RStudio Server の Docker イメージを作りました。入っているメインコンテンツは、tidyverse なパッケージ群、MeCab および {RMeCab}パッケージ、LaTeX環境です。また、ggplot2 などでの日本語プロットも文字化けしないようにIPAexフォントを入れています。

RStudio Server の構築手順

Docker をインストール

OS によって変わってくるので、各自検索してください。自分は Mac で boot2docker を使っています。この環境の場合、こちらなどが参考になります。以下、Docker がインストールされていて docker コマンドが使えることを前提とします。

2017-03-27

tidyverseの正式登場でDockerまわり(rocker)もいろいろ変わってた

R RStudio Docker

はじめに

データ分析では再現性が大切です。しかし、同じコードとデータを使っていても実行環境の違い(OS, ソフトやパッケージのバージョンなど)によって結果が異なることがあります。複数の場所で同じ環境をそろえるための手段の一つとして、はオープンソースのコンテナー管理ソフトウェアであるDockerを使うことが考えられます。Dockerのデータ分析での活用については以下の記事が詳しいです。

qiita.com

tidyverseの登場とDockerまわりの変化

さて、昨年のRStudio ver1.0 のリリースとほぼ同時期にtidyverseが登場し、RStudio Server のDockerイメージを提供しているrockerでのコンテナの種類も変わっていたようです。それまではhadleyverse*1(便利なパッケージ群)とLaTeX環境が入った rocke/hadleyverse がメインだったのが、現在は追加されるパッケージやソフトに合わせて以下の4つになっています。

rocker/r-ver…debian をベースにRの実行環境を入れたもの
rocker/rstudio… r-ver に RStudio Server を追加したもの
rocker/tidyverse… rstudio に tidyverse なパッケージ群を追加したもの
rocker/verse… tidyverse に lateX環境なパッケージ群を追加したもの

rocker/hadleyverseも生きてはいますが、Docker Hub の冒頭に「これじゃなくて代わりにtidyverse使えよ」って書いてあります。

別にhadleyverseを使ったからと言って何か不都合があるわけではないのですが、RStudio Server の環境構築にDockerを使う場合や自分でDockerイメージを作る場合は頭の片隅に入れておくと良さそうです、＆tidyverse周りはまだこれからも変わる(とHadley Wickhamが仄めかしている)可能性が高いので、Rのパッケージと同時にDockerまわりも注視していきたいです。

*1:詳しくは俺たちのtidyverseはこれからだ！ - Technically, technophobic.を参照